13 февраля 2019 г. Минюст России в соответствии с Федеральным законом «О некоммерческих организациях» включил Некоммерческую организацию фонд «В защиту прав заключенных» в реестр некоммерческих организаций, выполняющих функции иностранного агента.

Факт соответствия организации признакам некоммерческой организации, выполняющей функции иностранного агента, установлен в ходе проведения Главным управлением Минюста России по Москве внеплановой документарной проверки.